דורותה הושון-פופקו
שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.שגיאת תסריט: היחידה "תבנית מידע/אישיות" אינה קיימת.שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.
דורותה הושון-פופקו (נולדה: 23 בדצמבר 1974) היא ראש האוסף המולקולרי במוזיאון הטבע על שם שטיינהרדט בתל אביב ופרופסור חבר בבית הספר לזואולוגיה באוניברסיטת תל אביב.
תחומי המחקר העיקריים שלה הם פילוגנטיקה, גנום ואבולוציה מולקולרית, תוך התמקדות במיקסוזואה, אצטלנים, ספוגיים ויונקים קטנים.
ביוגרפיה[עריכה]
הושון נולדה וגדלה בצרפת, עלתה לישראל בשנת 2003.
השכלה[עריכה]
הושון פופקו למדה לתואר ראשון ולימודי המשך בביולוגיה, אקולוגיה ואבולוציה בהצטיינות יתרה מאוניברסיטת מונפלייה השנייה בצרפת (1995), קיבלה תואר שני במגוון ביולוגי באוניברסיטת פריז XI בהצטיינות יתרה (1997).
בשנת 2000 קיבלה דוקטורט בפילוגנטיקה מולקולרית מבמכון למדעי האבולוציה של מונפלייה באוניברסיטת מונפלייה השנייה (צרפת). את הדוקטורט עשתה בהנחיית פרופסור עמנואל דוזרי ופרנסואה קצפליס.
בשנת 2001 הייתה פוסט-דוקטורנטית במכון הטכנולוגי של טוקיו, יוקוהמה, יפן בשנת 2002 הייתה פוסט-דוקטורנטית באוניברסיטת המדינה של פלורידה, טלהסי, ארצות הברית.
באקדמיה[עריכה]
מאז אוקטובר 2003 היא חברת סגל במחלקה לזואולוגיה של אוניברסיטת תל אביב ואוצרת האוסף השיטתי של מוזיאון הטבע על שם שטיינהרדט.
ב-2013 מונתה לפרופסור במחלקת הזואולוגיה של אוניברסיטת תל אביב .
מחקריה[עריכה]
עיקר מחקרה עוסק בהבנה טובה יותר של היחסים האבולוציוניים בין בעלי חיים. במעבדה באוניברסיטה היא עוסקת בקבוצות בעלי חיים המרוחקות זו מזו, כגון מכרסמים, ספוגיים, מיקסוזואנים ומיתרני זנב.
במחקריה היא משלבת את הדור הבא של ריצוף גנטי (NGS) וכלי ביואינפורמטיקה חדישים כדי לשחזר את האבולוציה של בעלי חיים.
תחומי המחקר שלה כוללים:
- פילוגנומיה - שחזור קשרים אבולוציוניים בין מינים בהתבסס על ניתוחים בקנה מידה גנום.
- אבולוציה מולקולרית - מסדי נתונים גנומיים בקנה מידה גדול ופרויקטים של רצף תפוקה גבוהה בשילוב עם גישות ניסויות מאפשרים לנו כעת לקבל תובנות לגבי התפתחות הגנום.
- שימוש בדמויות דיסקרטיות כסמנים פילוגנטיים - רצף וניתוח רטרוטרנספוזונים גנומיים (SINES ו-LINES), וניתוח תווי החדרה ומחיקה ברצפי חלבונים על מנת להסיק קשרים פילוגנטיים.
- פילוגוגרפיה - הבנת וריאציה ברצף ברמת המין, והמתאם שלה עם וריאציה מרחבית.
תחומי עניין אלה אינם סותרים זה את זה ונעשה שילוב שלהם על מנת לחקור שושלות ספציפיות של בעלי חיים.
ב-2015 הובילה מחקר בשיתוף עם חוקרים מאוניברסיטת קנזס, מהרווארד, מהמרכז הלאומי לחקלאות ימית שבאילת וממכון CNRS שבצרפת. במחקר התגלה כי טפיל מיקרוסקופי שחי בדגים ושויך לממלכת הפרוטסיטים, הוא בעל חיים שהתפתח ממשפחת המדוזות. צוות חוקרים מאוניברסיטת תל אביב ומאוניברסיטת קנזס יישם את טכנולוגיית הדור הבא לריצוף גנים (NGS) על טפיל מיקרוסקופי בשם מיקסוזואה שחי בדגים. החוקרים הופתעו לגלות כי היצור הוא קרוב משפחה של המדוזות, ולכן אין ספק שמדובר בבעל חיים ממשפחת הצורבניים. המחקר התפרסם בכתב העת היוקרתי PNAS.[1][2] המיקסוזואה מורכב מתאים בודדים, מתנהג כמו טפיל חד-תאי, ושויך בעבר לממלכת הפרוטיסטים - יצורים שאינם בעלי חיים, צמחים או פטריות. המבנה החיצוני שלו אינו מאפשר למדענים לקבוע את מקורו האבולוציוני, ולכן ביקשנו להתבונן בגנום שלו - דבר שהתאפשר לאחרונה, בזכות טכנולוגיית הדור הבא לריצוף גנים.
ב-2020 גילתה כי המיקסוזואה הנמצא על השריר של דג הסלמון אינו נושם חמצן. המיקסוזואה הזעיר, המורכב מעשרה תאים בלבד, אינו דומה לכל בעלי החיים האחרים המוכרים למדע. המין, Henneguya סלמיניקולה, אינו נושם חמצן.[3][4][5]הטפיל הזעיר, פחות מ-10 תאים הננגויה סלמיניקולה, חי בשרירי הסלמון, לפי הממצא שפורסם ביום שלישי בכתב העת Proceedings of the National Academy of Sciences (PANS).[6] התגלית הכתה גלים בעולם, כי הייתה זו הפעם הראשונה שהתגלה בעל חיים שאינו נושם חמצן. [7][8][9][10]
ב-2020 הייתה מעורבת במחקר, בהובלת פרופ' עודד רכבי, שחקר את המאפיינים הגנטיים של העורות עליהם נכתבו מגילות קומראן וזאת על מנת להבדיל בין סוגי המגילות השונות.[11][12]
ב-2021 הייתה מעורבת במחקר יחד עם פרופסור נועה שנקר שגילה שאחד מסוגי האצטלן, מהמין Polycarpa mytiligera, שהינו בעל חיים ימי השייך למערכת המיתרניים, ונפוץ במפרץ אילת, מסוגל לחדש את כל איבריו – אם מחלקים אותו, אפילו ל־3 חלקים, ככה שכל חלק יודע לשחזר את כל מערכות הגוף החסרות תוך זמן קצר. [13][14] [15]
נושאי מחקר פעילים[עריכה]
1.אבולוציה של גנומים מיקסוזואנים (בשיתוף פרופ' אריק דיאמנט, המרכז הלאומי לחקלאות ימית, ופרופ' פאולין קרטרייט, אוניברסיטת קנזס). עם אלפי פרטים, מיקסוזואה היא בין קבוצת בעלי החיים שפחות נחקרה. לטפילים אלה ארגון פשוט מאוד אך מחזור חיים מורכב, כאשר הוא טפיל אשר נמצא על תולעים טבעתיות ודגים. למרות שידוע שהם גורמים נזק לחקלאות ימית של דגים, עם השלכות כלכליות חשובות, נחקרו מעט מאוד גנים הקשורים למינים אלה. באמצעות ריצוף אילומינה נעדה ניסיון לשפר את ההבנה של התפתחות הגנום של המיקסוזואה, ולהסביר את היחסים הפילוגנטיים שלו.
2. פילוגניה של מיתרני זנב (בשיתוף ד"ר נועה שנקר, אוניברסיטת תל אביב, ופרופ' כרמלה גיסי, אוניברסיטת בארי אלדו מורו).
מיתרני זנב יוצרים קבוצה מגוונת של בעלי חיים ימיים, יושבים או פלנקטוניים. אפלוסוברנצ'יה הוא תת-המיןהגדול ביותר של מיתרי הזנב. למרות שהאפלוסוברנצ'ים כוללים כמה מינים פולשניים, מעט מאוד ידוע על הפילוגניה שלהם: היחסים המשפחתיים שלהם אינם ידועים ואפילו מספר המשפחות היוצרות תת-מין זה עדיין שנוי במחלוקת. במחקריה מנסה לרצף גנומים מיטוכונדריאליים מלאים עבור נציג של המגוון המשפחתי, על מנת לפתור מערכות יחסים בתוך אפלוסוברנצ'יה .
חיים אישיים[עריכה]
פרופסור הושון-פופקו נשואה לפרופסור טל פופקו, ביולוג חישובי. לזוג ארבעה ילדים והם מתגוררים בתל אביב.
קישורים חיצוניים[עריכה]
- דורותה הושון-פופקו באתר של אוניברסיטת תל אביב
== שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.
דורותה הושון-פופקו, ברשת החברתית פייסבוק
דורותה הושון-פופקו, ברשת החברתית טוויטר
דורותה הושון-פופקו, ברשת החברתית אינסטגרם
דורותה הושון-פופקו, ביישום טיקטוק
דורותה הושון-פופקו, ברשת החברתית VK
דורותה הושון-פופקו, ביישום טלגרם
דורותה הושון-פופקו, אישיות ברשת החברתית LinkedIn- דורותה הושון-פופקו, חברה ברשת החברתית LinkedIn
דורותה הושון-פופקו, ברשת החברתית myspace
דורותה הושון-פופקו, סרטונים בערוץ היוטיוב
דורותה הושון-פופקו, סרטונים באתר Vimeo
[%3Cstrong_class%3D%22error%22%3E%3Cspan_class%3D%22scribunto-error%22_id%3D%22mw-scribunto-error-39%22%3E%D7%A9%D7%92%D7%99%D7%90%D7%AA_%D7%9C%D7%95%D7%90%D7%94_%D7%91%D7%99%D7%97%D7%99%D7%93%D7%94_package.lua_%D7%91%D7%A9%D7%95%D7%A8%D7%94_80:_module_%27%D7%99%D7%97%D7%99%D7%93%D7%94:PV-options%27_not_found.%3C/span%3E%3C/strong%3E%3Cstrong_class%3D%22error%22%3E%3Cspan_class%3D%22scribunto-error%22_id%3D%22mw-scribunto-error-40%22%3E%D7%A9%D7%92%D7%99%D7%90%D7%AA_%D7%9C%D7%95%D7%90%D7%94_%D7%91%D7%99%D7%97%D7%99%D7%93%D7%94_%D7%99%D7%97%D7%99%D7%93%D7%94:PropertyLink_%D7%91%D7%A9%D7%95%D7%A8%D7%94_218:_attempt_to_index_field_%27wikibase%27_(a_nil_value).%3C/span%3E%3C/strong%3E דורותה הושון-פופקו], הבלוג הרשמימבחר פרסומים ==- Shenkar N., Koplovitz G., Dray L., Gissi C. & Huchon D. (2016) Back to solitude: solving the phylogenetic position of the Diazonidae using molecular and developmental characters. Molecular Phylogenetics and Evolution. 100:51-56.
- Huchon D., Szitenberg A., Shefer S., Ilan M. & Feldstein T. (2015) Mitochondrial Group I and Group II introns in the sponge orders Agelasida and Axinellida. BMC Evolutionary Biology. 15:278.
- Chang S. E., Neuhof M., Rubinstein N. D., Diamant A., Philippe H., Huchon D. & Cartwright P. (2015) Genomic insights into the evolutionary origin of Myxozoa within Cnidaria. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 112:14912–14917.
- Ashkenazy H., Cohen O., Pupko T. & Huchon D. (2014) Indel reliability in indel-based phylogenetic inference. Genome Biology and Evolution. 6:3199–3209.
- Shpirer E., Chang S., Diamant A., Rubinstein N., Cartwright P. & Huchon D. (2014) Diversity and evolution of מיקסוזואה minicollagens and nematogalectins. BMC Evolutionary Biology. 14:205.
- Rubinstein N. D., Feldstein T., Shenkar N., Botero-Castro F., Griggio F., Mastrotorato F., Delsuc F., Douzery E. J. P., Gissi C. & Huchon D. (2013) Deep sequencing of mixed total DNA without barcodes allows efficient assembly of highly plastic ascidian mitochondrial genomes. Genome Biology and Evolution. 5:1185–1199.
- Churakov G., Sadasivuni M.K., Rosenbloom K., Huchon D., Brosius J. & Schmitz J. (2010) Rodent evolution: back to the root. Molecular Biology and Evolution. 27:1315-1326.
- Belinky F., Cohen O. & Huchon D. (2010) Large-scale parsimony analysis of metazoan indels in protein-coding genes. Molecular Biology and Evolution. 27:441–451.
- Blanga-Kanfi S., Miranda H., Penn O., Pupko T., DeBry R.W. & Huchon D. (2009) Rodent phylogeny revised: analysis of six nuclear genes from all major rodent clades. BMC Evolutionary Biology. 9:71.
- Huchon D., Chevret P., Jordan U., Kilpatrick W. C., Ranwez V., Jenkins P. D., Brosius J. & Schmitz J. (2007) Multiple molecular evidences for a living mammalian fossil. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 104:7495–7499.
.svg){kind=icon}
הערות שוליים[עריכה]
שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.מהו בעל חיים? תגלית חדשה מאוניברסיטת תל-אביב עשויה לשנות את ההגדרות הבסיסיות ביותר, www.tau.ac.il
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.E. Sally Chang, Moran Neuhof, Nimrod D. Rubinstein, Arik Diamant, Hervé Philippe, Dorothée Huchon, Paulyn Cartwright, Genomic insights into the evolutionary origin of Myxozoa within Cnidaria, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112, 2015-12-01, עמ' 14912–14917 doi: 10.1073/pnas.1511468112
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Salmon parasite is world’s first non-oxygen breathing animal - UPI.com, UPI (בEnglish)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Dayana Yahalomi, Stephen D. Atkinson, Moran Neuhof, E. Sally Chang, Hervé Philippe, Paulyn Cartwright, Jerri L. Bartholomew, Dorothée Huchon, A cnidarian parasite of salmon (Myxozoa: Henneguya ) lacks a mitochondrial genome, Proceedings of the National Academy of Sciences 117, 2020-03-10, עמ' 5358–5363 doi: 10.1073/pnas.1909907117
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.PTI, Scientists discover animal that doesn't need oxygen to survive, Deccan Herald (בEnglish)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Republic World, Scientists discover Henneguya Salminicola, a life form that lives without oxygen, Republic World, 2020-02-27 (בEnglish)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Creature that doesn’t need oxygen for survival, www.thehitavada.com (בEnglish)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Scientists Discover First-Ever Animal That Doesn't Breathe, International Business Times, 2020-02-25 (בen-US)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Jeff Parsons, Scientists accidentally discover animal that doesn't breathe oxygen, Metro, 2020-02-26 (בEnglish)
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.David Aaro, Scientists discover first animal that can survive without oxygen, Fox News, 2020-02-27 (בen-US)
- ↑ שגיאת תסריט: היחידה "citation/CS1" אינה קיימת.
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Illuminating genetic mysteries of the dead sea scrolls, scholar.google.co.il
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.אוניברסיטת תל אביב, בעל חיים שמסוגל לחדש את כל האיברים שלו – אפילו אם מחלקים אותו לשלושה חלקים, הידען, 2021-05-01
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.Tal Gordon, Arnav Kumar Upadhyay, Lucia Manni, Dorothée Huchon, Noa Shenkar, And Then There Were Three…: Extreme Regeneration Ability of the Solitary Chordate Polycarpa mytiligera, Frontiers in Cell and Developmental Biology 9, 2021 doi: 10.3389/fcell.2021.652466/full
- ↑ שגיאת לואה ביחידה package.lua בשורה 80: module 'יחידה:PV-options' not found.N12 - תגלית מפתיעה באילת: בעל חיים שמחדש את כל איבריו, N12, 2021-04-21
This article "דורותה הושון-פופקו" is from Wikipedia. The list of its authors can be seen in its historical and/or the page Edithistory:דורותה הושון-פופקו. Articles copied from Draft Namespace on Wikipedia could be seen on the Draft Namespace of Wikipedia and not main one.
